紫花苜蓿bZIP基因家族的鉴定、进化及表达分析

• 作者: 刘文献 孙启忠 张正社 闵学阳 齐晓
• 来源期刊: 草业科学
• 学科: 农学
• 关键词: bZIP转录因子 紫花苜蓿 系统进化分析 密码子偏好性
• 年，卷（期）: 2017,（8）
• 所属期刊栏目: 植物生产层
• 页码范围: 1635-1648
• 页数: 14页
• 分类号: S541+.1|Q786
• 字数: 6820字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11829/j.issn.1001-0629.2016-0520

摘要

碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子是真核生物转录因子中分布最广泛、最保守的一类蛋白.目前在许多植物中已发现大量的bZIP转录因子,这些bZIP转录因子成员广泛参与种子贮藏基因的表达、植物的生长发育、光信号传导、病害防御、生物和非生物胁迫应答以及ABA的敏感性等各种信号的反应.本研究首次从紫花苜蓿(Medicago sativa)全转录组水平鉴定出bZIP转录因子家族共包含138个基因,根据bZIP蛋白序列进行系统进化分析可以将其分为10类;对MsbZIP基因的系统进化分析表明该基因家族在分类上有很高的保守性.该转录因子家族的基因密码子偏好性分析表明,MsbZIP基因密码子偏好使用A/T碱基.此外,MsbZIP基因GO功能注释分析结果显示,138个MsbZIP基因最终分为23个GO分类,总体包括分子功能和生物学过程两类.相关性分析结果表明,共有372对基因表达相关性极显著(P<0.01).本研究可为紫花苜蓿bZIP转录因子功能特性、进化历程和生物功能的深入研究奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙启忠	中国农业科学院草原研究所	197	2315	23.0	37.0
2	刘文献	草地农业生态系统国家重点实验室兰州大学草地农业科技学院	5	39	4.0	5.0
3	齐晓	中国农业科学院草原研究所	8	188	6.0	8.0
7	闵学阳	草地农业生态系统国家重点实验室兰州大学草地农业科技学院	2	11	1.0	2.0
8	张正社	草地农业生态系统国家重点实验室兰州大学草地农业科技学院	3	18	2.0	3.0