基于转录组测序的滇山茶花叶呈色机理分析

• 作者: 徐晓丹 王炜 王谈笑 郑伟 陈菁
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 滇山茶 叶色 转录组 叶绿素代谢 类黄酮生物合成
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1720-1727
• 页数: 8页
• 分类号: Q789
• 字数: 6087字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2017.09.1720

摘要

该研究采用Illumina Hi-Seq2500高通量测序技术,对滇山茶的花叶(绿叶区和金叶区)的cDNA进行了转录组测序,分析滇山茶的花叶呈色机理.测序结果得到了228 862条单基因序列,筛选得到了4 851条差异表达基因.2 291条差异表达基因在GO数据库中有功能注释,1 826条差异表达基因被注释到COG数据库,这些差异表达基因被分为23个主要功能类别,其中大部分基因与滇山茶的生长和代谢有关.1 363条差异表达基因注释到了KEGG数据库,进一步筛选出了差异表达基因注释序列最多的15条代谢通路,其中卟啉和叶绿素代谢途径中的GluRS、δ-ALAD、ALAS基因和类黄酮合成途径中ANS、LAR、CHS基因与滇山茶的花叶形成密切相关.研究表明,滇山茶的花叶呈色是由于叶色相关代谢通路中大量的基因表达量发生变化引起的,并不是由单基因突变所致,病毒诱导的多个代谢途径基因沉默可能是滇山茶花叶呈色的主要原因.该研究丰富了滇山茶的转录组信息,并为滇山茶的彩叶品种培育提供了一定的参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑伟	昆明理工大学建筑与城市规划学院	15	138	5.0	11.0
2	王炜	昆明理工大学建筑与城市规划学院	5	17	3.0	4.0
3	徐晓丹	昆明理工大学艺术与传媒学院	5	19	3.0	4.0
4	陈菁	昆明理工大学现代农业工程学院	5	19	3.0	4.0
5	王谈笑	昆明理工大学现代农业工程学院	4	17	3.0	4.0