贵州烟田马铃薯Y病毒优势株系全序列克隆及系统进化分析

• 作者: 夏范讲 贾蒙骜 郭玉双
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 马铃薯Y病毒 基因组序列 系统进化分析
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 页码范围: 34-39
• 页数: 6页
• 分类号: S43
• 语种: 中文
• DOI: 10.11841/j.issn.1007-4333.2017.07.04

摘要

为了解马铃薯Y病毒在贵州烟田的发生和流行规律,对2013-2015年采集到的贵州省多个烟区呈现典型茎脉坏死症状的疑似受马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)侵染的烟草样品进行单斑分离和病毒鉴定,并以现有PVY序列信息为参考,设计了4对PVY特异引物,经过RT PCR扩增、T载体连接、序列测定以及序列拼接,并利用MEGA软件进行系统进化分析.结果发现PVY福泉分离物(PVY Fuquan isolate,PVY-FQ)和PVY大方分离物(PVY Dafang isolate,PVY-DF)为优势株系并获得了PVY-FQ和PVY-DF的全基因组序列.PVY FQ整条基因组由9 699个碱基组成,编码多聚蛋白的开放阅读框位于第188～9 373 nt;PVYDF整条基因组由9 706个碱基组成,编码多聚蛋白的开放阅读框位于第190～9 375 nt.2条序列的基本特征与已报道PVY基因组一致.对PVY-FQ和PVY-DF全序列与已报道PVY序列进行系统进化分析发现,PVY-FQ与PVY NTN株系具有较高的亲缘关系,而PVY-DF与PVYN具有较高亲缘关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭玉双	贵州省烟草科学研究院烟草行业重点实验室	31	163	7.0	12.0
2	贾蒙骜	贵州省烟草科学研究院烟草行业重点实验室	9	47	4.0	6.0
3	夏范讲		2	8	1.0	2.0