‘黑油椿’香椿嫩芽高通量转录组测序及萜类代谢物质初步分析

• 作者: 吕伟健 唐开静 范小莹 赵胡
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 香椿 转录组 功能注释 萜类代谢
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 2135-2149
• 页数: 15页
• 分类号: S644.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2017-0282

摘要

‘黑油椿’香椿(Toona sinensis‘Heiyouchun’)嫩芽富含萜类物质,主要以倍半萜为主,其中去氢香橙烯、9,10-脱氢异长叶烯和β-石竹烯含量分别高达4 440.71,1 932.02和1 799.89 ng·g-1.采用高通量RNA-seq测序技术(Illumina HiSeqTM4000)对嫩芽进行转录组测序,获得高质量的碱基数据量为4.70 Gb,共计86 870个转录本(Transcript),对这些转录本进一步组装,得到55 850个单基因簇(Unigene),平均长度为1 013 bp.序列同源性比对表明,39 408个单基因簇与数据库中其他物种基因存在不同程度的同源性,功能注释匹配度最高的物种为甜橙(Citrus sinensis).将全部单基因簇进行GO数据库比对,19 704个单基因簇获得GO功能注释,分为细胞组分、分子功能和生物学过程等3大类群和54个亚类,其中与代谢过程、细胞组分、结合和催化活性及细胞过程相关的单基因簇占绝大多数.利用COG数据库进行比对,14 186个单基因簇分布于25个功能区域.KEGG代谢通路数据库比对,有28 400个单基因簇获得功能注释,分为6大类,21个亚类和135个代谢途径分支.通过对转录组数据进一步分析发现,参与‘黑油椿’嫩芽风味形成相关萜类合成的单基因簇共计467个,其中参与萜类骨架生物合成、单萜生物合成、倍半萜和三萜类合成、二萜合成的单基因簇分别为226、71、86、84个,这为进一步研究香椿萜类物质生物合成相关的基因功能及解析其风味物质形成的分子机制提供了基础数据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵胡	阜阳师范学院生物与食品工程学院抗衰老中草药安徽省工程技术研究中心	30	154	7.0	11.0
2	唐开静	阜阳师范学院生物与食品工程学院抗衰老中草药安徽省工程技术研究中心	1	4	1.0	1.0
3	范小莹	阜阳师范学院生物与食品工程学院抗衰老中草药安徽省工程技术研究中心	1	4	1.0	1.0
4	吕伟健	阜阳师范学院生物与食品工程学院抗衰老中草药安徽省工程技术研究中心	1	4	1.0	1.0