37份新疆粳稻品种(系)的IRAP遗传多样性分析

• 作者: 张燕红 王奉斌 袁杰 贾春平 赵志强
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 新疆粳稻 反转录转座子 IRAP 种质资源 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1102-1110
• 页数: 9页
• 分类号: Q789
• 字数: 5621字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2017.06.1102

摘要

该研究基于4个稻属(Oryza)反转录转座子,包括活性、低拷贝〔Tos17/Osr21 (Ty1-copia)和RIRE7/Osr31 (Ty3-gypsy)〕和非活性、高拷贝〔Osr34 (Ty3-gypsy)和Houba/Tos5/Osr13 (Ty1-copia)〕,在两侧翼长末端重复序列(LTR)区域分别设计引物,对37份新疆粳稻(Oryza sativa L.ssp.japonica)栽培品种(系)进行PCR扩增.评估鉴定适用于反转录转座子插入位点间扩增多态性(IRAP)标记方法,并分析37份供试品种(系)的遗传多样性.(1)PCR扩增结果显示,Tos17/Osr21、RIRE7/Osr31、Osr34和Houba/Tos5/Osr13依次获得73、63、107和560条谱带,其中多态性条带36、63、70和523个,多态性比率为49.3%、100.0%、65.4%和93.4%.(2)综合评估比较多态性、异质性、总谱带数和平均多态性谱带数发现,Houba/Tos5/Osr13适用于IRAP标记方法构建DNA指纹图谱数据库.(3)以Houba/Tos5/Osr13遗传相似系数为基础,对供试品种(系)采用非加权平均(UPGMA)法进行聚类分析显示,以0.55为阈值将37份新疆粳稻栽培品种(系)分为6大类群,绝大多数品种(系)得到了明确的区分,品种间的遗传相似性较高,多样化程度偏低;品系'20-18'和'96-16'分别各自聚为一类,表明品系与品种间遗传背景较远,多样化程度较高.综上所述,IRAP分子标记适用于新疆粳稻种质资源的亲缘关系分析、鉴别及育种遗传距离的判定和DNA指纹图谱数据库构建等相关研究,在实际育种中选取不同类群的水稻品种与品系进行杂交选育,成功率较高,可能会大大缩短优良品种的选育进程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王奉斌	新疆农业科学院核技术生物技术研究所	21	70	5.0	7.0
2	袁杰	新疆农业科学院核技术生物技术研究所	20	60	4.0	6.0
3	张燕红	新疆农业科学院核技术生物技术研究所	21	84	5.0	7.0
4	赵志强	新疆农业科学院核技术生物技术研究所	14	22	3.0	4.0
5	贾春平	新疆农业科学院核技术生物技术研究所	7	7	2.0	2.0