猪流行性腹泻病毒广东分离株GD/JMEP的遗传演化分析

• 作者: 刘琪 周如月 王贵平 贾爱卿
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 遗传变异 S基因 N基因 M基因
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 74-80
• 页数: 7页
• 分类号: S852.65
• 字数: 3857字
• 语种: 中文

摘要

为了解广东地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行现状,对广东地区猪场进行了PEDV流行株的分离,分离得到1株猪流行性腹泻病毒,对分离毒株的S、N、M及ORF3基因进行遗传演化分析.结果表明:检测的PEDV毒株GD/JMEP与经典的CV777毒株亲缘关系较远,与近几年广东地区流行的PEDV毒株处于一个群,亲缘关系较近;通过ORF3序列分析发现,未有核苷酸的缺失;N、M基因核苷酸和氨基酸同源性分析发现,GD/JMEP与EAS1等经典毒株的同源性相对较低,与2013-2015年中国、美国、韩国等流行毒株的同源性较高;相比于经典传统毒株CV777,GD/JMEP的N基因存在9个氨基酸的差异,M基因存在11个核苷酸位点的变异和3个氨基酸的改变S基因存在几个位点核苷酸的缺失或者插入;与目前流行毒株比较,M、N基因存在核苷酸位点的改变,S基因在406位点存在新的突变;通过氨基酸比对分析,GD/JMEP发生了6个新的氨基酸位点突变,表明本试验所检测的PEDV为目前广东流行毒株.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘琪		13	51	4.0	6.0
2	周如月		12	50	4.0	6.0
3	王贵平		39	107	5.0	7.0
4	贾爱卿		16	65	5.0	6.0