桃FLA家族基因的生物信息学及表达分析

• 作者: 卞坤 徐利伟 杨震峰 沈子明 邵佳蓉 陈伟
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 桃 果实 成束域 阿拉伯半乳糖蛋白 生物信息学 表达分析
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 653-663
• 页数: 11页
• 分类号: S662.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0604

摘要

从桃基因组数据库筛选出了12个假定的成束状阿拉伯半乳糖蛋白(FLA)基因序列.对其蛋白结构进行分析,结果显示PpFLA7不具有特定的阿拉伯糖或半乳糖糖基化位点,不属于典型的FLA家族.PpFLA6的氨基酸组成和保守域的分布与其他成员相比差别较大.聚类分析结果表明PpFLAs家族可以分为Clade Ⅰ、CladeⅡ和Clade Ⅲ 3类.利用荧光定量PCR (qPCR)对不同组织和成熟阶段果实中的FLA进行表达分析,发现各个成员在不同时期的组织中差异化表达,其中PpFLA4在果实成熟阶段显著上调表达,暗示其可能在桃果实的成熟阶段扮演重要角色.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈伟	浙江万里学院生物与环境学院	61	485	11.0	19.0
2	杨震峰	浙江万里学院生物与环境学院	51	394	11.0	17.0
3	徐利伟	浙江万里学院生物与环境学院	4	9	1.0	3.0
4	沈子明	上海海洋大学食品学院	3	9	1.0	3.0
6	邵佳蓉	浙江万里学院生物与环境学院	6	32	3.0	5.0
9	卞坤	上海海洋大学食品学院	1	0	0.0	0.0