新型等点聚焦系统用于蛋白质组样本的预分离方法研究

• 作者: 李蕾 胡家 薛冰 赵君朋
• 来源期刊: 分析试验室
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质组学 OFFGEL 3100 等电聚焦,串联质谱
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告与研究简报
• 页码范围: 1335-1340
• 页数: 6页
• 分类号: TQ937
• 语种: 中文
• DOI: 10.13595/j.cnki.issn1000-0720.2017.0287

摘要

对蛋白质或多肽的高效分离,将有利于降低肽段信号之间的干扰,保证规模化的蛋白质组学深度覆盖鉴定,并提高定量蛋白质组分析的准确性.本研究采用一种新型的等电聚焦预分离系统(OFFGEL),考察系统对293T细胞在蛋白质与肽段水平的分级分离效果,在OFFGEL系统中聚焦后的蛋白质或肽段可以从溶液中直接回收,与下游的LC-MS/MS肽段鉴定流程兼容.实验结果表明,肽段的分离效果明显优于蛋白质的分离,分级分离后各馏分对应的等电点位置与肽段的理论等电点分布高度一致,每个馏分中单独鉴定的肽段比例超过90％,显示了该系统对肽段的高分辨分离能力,结合生物质谱技术,在293T细胞中实现6727个蛋白质的规模化鉴定,表明该系统在复杂体系蛋白质组研究中的应用潜力.