肝癌细胞HepG2中p53调控miRNA-3661的生物信息分析与功能验证

• 作者: 康成宇 张一鸣 李宇鹏 李牧洲 胡海碧 郭志云
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 肝细胞癌 microRNAs 生物信息学 阿霉素
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 216-223
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.20170005

摘要

对已在前期实验中通过Dox诱导肝癌细胞HepG2 DNA损伤发现的受p53调控的hsa-miR-3661进行生物信息学分析,并通过分子生物学实验对其功能进行了验证,为miR-3661在肝肿瘤中的调控机制的研究提供理论基础.获取miR-3661结构与序列信息;预测靶基因,使用DAVID进行miRNA靶基因功能富集分析;分析miR-3661的p53结合位点,通过基因间的相互作用构建调控网络;进行细胞增殖实验验证miR-3661抑制肿瘤功能.结果表明,miR-3661序列保守,启动子区存在p53结合位点,暗示p53与hsa-miR-3661存在直接调控;预测靶基因1009个,369个显著富集于细胞周期调控、细胞增殖、细胞凋亡等肿瘤相关生物学过程(P<0.05),主要参与了癌症信号通路、MAPK信号通路与ErbB信号通路(P<0.05);通过268组基因间的相互作用数据构建了p53、hsa-miR-3661和靶基因的调控网络,从系统生物学角度分析了参与多个肿瘤生物进程的关键靶基因;在实验中证实过表达miR-3661可以显著抑制肝癌细胞HepG2的增殖过程(P-value=0.00146).miR-3661受p53直接调控,其靶基因显著富集于多种肿瘤相关生物进程与信号通路,过表达miR-3661可显著抑制肝癌细胞增殖.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭志云	西南交通大学生命科学与工程学院	14	41	4.0	6.0
2	李宇鹏	西南交通大学生命科学与工程学院	3	3	1.0	1.0
3	张一鸣	西南交通大学生命科学与工程学院	3	3	1.0	1.0
4	胡海碧	西南交通大学生命科学与工程学院	2	1	1.0	1.0
5	康成宇	西南交通大学生命科学与工程学院	1	1	1.0	1.0
6	李牧洲	西南交通大学生命科学与工程学院	1	1	1.0	1.0