黄瓜Ca2+家族序列特征及其表达特性分析

• 作者: 杜伟玲 盛慧
• 来源期刊: 广东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜 Ca2+家族 组织特异性 信号传导
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 园艺林学
• 页码范围: 61-66,封2
• 页数: 7页
• 分类号: S642.2|Q786
• 字数: 2765字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16768/j.issn.1004-874X.2017.03.009

摘要

通过黄瓜基因组数据库,采用生物信息学方法获得15个黄瓜Ca2+家族序列,并对其染色体位置、基因组位置、氨基酸长度、转录起始位点和Pfam匹配结构域数进行预测;利用RT-PCR方法对所有搜索到的Ca2+家族基因进行组织特异性分析;对黄瓜植株进行低温处理,分析黄瓜Ca2+基因家族的表达情况.结果显示:15个基因中除Csa021245未定位以外,其余均匀分布在1～6号染色体上,一致性为47.67％;Csa001688、Csa009857和Csa009360等3个基因的5'区出现CpG岛结构;组织表达特异性分析结果显示,Csa001688、Csa006826、Csa010172和Csa016434在叶中表达量最高,Csa003758、Csa010172和Csa018949在根中表达量最高;进化树分析结果显示,只有Csa010172和Csa009360与拟南芥AtACA2亲缘关系最近,这些基因可能在Ca2+家族信号传导过程中起着主要作用;实时定量表达分析表明,Ca2+基因家族参与黄瓜对低温胁迫的应答.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	盛慧	哈尔滨市农业科学院生物中心	8	18	3.0	4.0
2	杜伟玲	哈尔滨市农业科学院生物中心	9	40	1.0	6.0