白花草木樨EST-SSR标记的开发与筛选

• 作者: 任艳 剡转转 吴凡 张代玉 张吉宇 张宇飞 赵玉凤 闫启 骆凯
• 来源期刊: 草业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 草木樨 EST-SSR 标记开发 多态信息含量 期望杂合度 遗传距离 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 植物生产层
• 页码范围: 1802-1814
• 页数: 13页
• 分类号: S541+.903|Q943.2
• 字数: 5921字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11829/j.issn.1001-0629.2016-0643

摘要

草木樨(Melilotus)是重要的豆科牧草之一,然而草木樨分子标记匮乏,限制了草木樨种质资源的开发与利用.本研究以白花草木樨(M.albus)转录组数据为基础,设计了18 182对草木樨EST-SSR引物,并对所开发的EST-SSR引物进行筛选.通过PCR扩增从550对EST-SSR引物中筛选得到206对白花草木樨多态性引物,共检测出679个等位基因,平均每对引物检测出2.888个基因位点.多态信息含量PIC的分布范围为0.239～0.855,平均值为0.468.206对多态性引物Nei's基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(Ⅰ)的平均值分别为0.169和0.239.本研究开发的EST-SSR丰富了草木樨属的分子标记,为研究种质资源的遗传多样性和分子辅助育种奠定了基础.