PRRSV上海浦东南汇分离株Nsp2与ORF5基因遗传演化分析

• 作者: 周光胜 张红飞 朱爱军 李金贵 王海根 邢涛 郁星星
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 鉴定 Nsp2 ORF5 序列分析
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 74-78
• 页数: 5页
• 分类号: S858.28
• 字数: 3160字
• 语种: 中文

摘要

对上海浦东南汇地区某规模猪场猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)疑似病料进行处理,提取病毒总RNA,采用RT-PCR方法扩增Nsp2/ORF5基因,并进行基因测序.序列分析结果表明,浦东南汇分离株Nsp2蛋白均缺失481位和第533～561位30个不连续的氨基酸,同时在Nsp2编码区出现与高致病性PRRSV (HP-PRRSV)代表株JXA1相同的遗传变异现象.同源性分析表明,6株Nsp2、ORF5氨基酸序列与VR-2332、CH-1a、HB-2以及JXA1株的同源性分别为:40.3％ ～ 55.3％,73.5％ ～ 89.5％;54.7％ ～ 75.1％,75.5％ ～ 92.5％;50.9％～ 67.3％,73.5％～90.5％;72.8％～91.5％,81.5％～98.5％;而与欧洲型代表株LV株的同源性分别仅为26.2％～ 35.9％和44.8％～ 56.4％.遗传演化分析表明,浦东南汇分离株与国内株(CH-1a、HB-2)和VR-2332美洲代表株各自处于相对独立的分支,遗传关系较远且不存在交叉现象,而与JXA1变异株处于同一进化分支.研究表明,浦东南汇分离株为美洲型HP-PRRSV毒株,具有一定的地理衍变特性,已从PRRSV遗传进化树中分离,出现一个新的遗传独立群体.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周光胜		15	23	3.0	4.0
2	李金贵	扬州大学兽医学院	65	285	10.0	12.0
3	邢涛		10	10	2.0	3.0
4	王海根		8	11	2.0	3.0
5	张红飞		7	4	1.0	1.0