应用克隆文库构建法研究枇杷根系AMF多样性

• 作者: 任禛 夏体渊 尹利方 朱维贤 赵晓红 陈泽斌 靳松 颜家亮
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 枇杷 AMF 克隆文库 18S rRNA基因 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源
• 页码范围: 1009-1015
• 页数: 7页
• 分类号: S667.3
• 字数: 5539字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2017.5.005

摘要

[目的]为进一步探寻和利用宝贵的AMF资源提供有效的研究方法.[方法]在昆明学院随机采集枇杷根系作为实验样品,采用CTAB法提取根系DNA,进行18S rDNA PCR扩增,产物连接转入大肠杆菌JM109受体,建立18S rRNA部分基因克隆文库.从文库中随机选取35个白色克隆子,经鉴定,获得30个阳性克隆子,将阳性克隆子测序.运用Mothur等软件分析阳性克隆子序列,确定9条差异序列,为不同的AMF序列.[结果]克隆文库的Coverage C值为93.3％,克隆文库的Shannon-Wiener指数为2.079,Simpson指数为0.87,且Rarefaction曲线比较饱和.9个序列分为了两个不同的类群,代表不同AMF种类;球囊霉属(Glomus)是枇杷根系的主要AMF类群,OUT1和OTU2代表了文库中的主要类型,其中OTU1为根内根生囊霉(Rhizophagus irregularis);OTU3、OTU4、OTU5和OTU6代表着文库中的常见类型;其余序列则为枇杷根系中的少见或稀有AMF类型.[结论]球囊霉属(Glomus)是枇杷根系的主要AMF类型,其中根内根生囊霉(Rhizophagus irregularis)为优势AMF种类.