胡萝卜类甜蛋白家族鉴定与生物信息学分析

• 作者: 刘潮 唐利洲 宋培兵 王海波 韩利红
• 来源期刊: 中国蔬菜
• 关键词: 胡萝卜 类甜蛋白 系统进化 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 38-44
• 页数: 7页
• 字数: 4446字
• 语种: 中文

摘要

为了全面了解胡萝卜基因组中类甜蛋白家族基因结构和蛋白功能,利用胡萝卜基因组数据库,通过生物信息学方法对筛选的32个胡萝卜类甜蛋白家族成员进行鉴定、聚类及结构功能分析.结果表明:胡萝卜类甜蛋白家族基因分布在8条染色体上,该家族蛋白保守性较强.系统发育分析显示,胡萝卜类甜蛋白家族属于10个进化组,其中进化组5中的基因主要来自1号染色体,该组成员具有抑菌潜力,值得深入研究.