不同可变数目串联重复序列组合对中国流行结核分枝杆菌分辨力的评价研究

• 作者: 刘静仪 原梅 孙照刚 张治国 李卫民 蔡超 贾俊楠 陈海霞 高基民 黄海荣
• 来源期刊: 中华流行病学杂志
• 关键词: 结核分枝杆菌 可变数目串联重复序列 基因分型 分辨率 成簇率
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 实验室研究
• 页码范围: 794-799
• 页数: 6页
• 字数: 4214字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2017.06.021

摘要

目的 在规范化的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)可变数目串联重复序列(variable number of tandem repeats,VNTR)基因分型的基础上,构建我国31个省(自治区、直辖市)VNTR数据库,每个省优化一套VNTR位点组合,为我国结核病预防控制策略的制定提供科学依据.方法 对2007-2008年全国结核病耐药性基线调查的4 116株MTB15位点VNTR(15-VNTR)基因分型.汉高指数(Hunter-Gaston Index,HGI)分析每个位点的分辨率.依据谱系流行特征,以分辨率高和稳定性强为原则,为各省设计一套VNTR优化组合(12-VNTR、10-VNTR、8-VNTR和5-VNTR),采用HGI和成簇率进行评价.结果 完成了涵盖率为96.36％(3 966/4 116)MTB完整15-VNTR图谱.发现QUB11b、MIRU26等7个高分辨率位点;QUB26、MIRU16、Mtub21、QUB1 1b在部分地区遗传稳定性差.内蒙古自治区、重庆市、黑龙江省的最优组合为10-VNTR,其他各省的最佳组合为8-VNTR.结论 VNTR数据库的建立将推动全国范围MTB传染源的追踪;各省优化VNTR组合的推出有助于当地结核病疫情的监测和群体遗传学的研究.