基于RNA-Seq技术的干酪基质下红曲霉生长转录组初步信息分析

• 作者: 焦晶凯
• 来源期刊: 中国酿造
• 学科: 工学
• 关键词: 红曲霉 干酪 转录组 RNA-Seq技术 基因注释
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 所属期刊栏目: 创新与借鉴
• 页码范围: 118-121
• 页数: 4页
• 分类号: TS261.1
• 字数: 2940字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11882/j.issn.0254-5071.2017.11.026

摘要

采用转录组测序(RNA-Seq)技术,对生长在干酪基质环境下的红曲霉(Monascus)进行了转录组分析.采用第二代测序技术,基于Illumina NextSeq 500测序平台进行分析,得到了序列总长度为59 935 140 bp的转录本(transcripts),22 377 414 bp长度的非重复序列基因(unigene),共18 042条.对聚类得到的Unigene与数据库NR、GO、KEGG、eggNOG和Swiss-Prot进行比对并作基因功能注释,注释到GO数据库的序列有12 186条,注释到eggNOG数据库的序列有17 777条,KEGG中有3 251条序列被注释到,涉及的pathway有42条.这些注释信息的完成在基因组学上为红曲霉应用于干酪的生产提供了重要依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	焦晶凯	上海乳业生物工程技术研究中心乳业生物技术国家重点实验室	1	0	0.0	0.0