新疆褐牛基因外显子多态性及其与SCS和泌乳性状关联性分析

• 作者: 刘丽元 周靖航 张梦华 方季青 李金霞 王爱芳 王雅春 谭世新 黄锡霞
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 新疆褐牛 SCS 泌乳性状 MassArray 关联分析
• 年，卷（期）: 2017,（13）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·资源昆虫
• 页码范围: 2592-2603
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2017.13.017

摘要

[目的]探索ERAP2,Cwc27,PFIBP2,HADA,ZNF804B和MHR2基因多态性与新疆褐牛体细随评分及泌乳性状的相关性,旨在寻找与新疆褐牛体细胞评分及泌乳性状相关的分子标记.[方法]以新疆乌鲁木齐种牛场、新疆天山畜牧生物工程股份有限公司共1 69头新疆褐牛母牛为试验对象,以2008-2015年间的生产性能测定记录(包括乳脂率、乳蛋白率、总固体含量、乳糖率和体细胞计数等)和305 d产奶量为试验数据,基于课题组前期1 5头中国荷斯坦牛DNA混池重测序的结果筛选外显子区域1 0个SNPs,采用基质辅助激光电离飞行时间质谱法(sequenom massArray genotype)分型技术验证10个SNP位点的遗传多态性,运用SAS8.1软件GLM过程对这1 0个SNP突变与新疆褐牛体细胞评分(SCS)、305 d产奶量、乳脂率、乳蛋白率、乳糖率和总固体的关联程度进行统计分析.[结果]10个SNP位点均具有多态性,x2检验表明群体中9个SNP位点符合Hardy-Weinberg平衡状态.关联分析结果表明ERAP2基因两个位点(T98741711C和G98736141A)均与新疆褐牛305 d产奶量达到极显著关联(P＜0.001),其中TT型和GG型个体的产奶量最高;PPFIBP2 (C45667492G)位点与新疆褐牛乳糖率达到显著关联(P＜0.005),其中GG型个体的乳糖率最高;Cwc27(T14533269A)位点与新疆褐牛乳脂率和总固体含量达到显著关联(P＜0.005),与SCS达到极显著关联(P＜0.001),其中TT型个体的乳脂率和总固体含量均最高,AA型个体的SCS极显著高于AT和TT型;AMHR2(C26758055G)位点与新疆褐牛乳蛋白率和总固体含量达到极显著关联(P＜ 0.001),其中GG型个体显著高于CC和GC型个体.连锁不平衡分析与单倍型构建的结果发现1 0个SNPs构建了两个单倍型模块,其中SNP1和SNP2位点之间处于连锁不平衡状态(r2＞0.3),SNP4和SNP10位点之间处于强连锁不平衡状态(r2＞0.6),随后分析了单倍型与SCS和泌乳性状之间的相关性,发现单倍型与新疆褐牛SCS和泌乳性状无显著关联(P＞0.001).[结论]初步发现了ERAP2,Cwc27,PPFIBP2和AMHR2与新疆褐牛SCS和泌乳性能相关,结果可为新疆褐牛产奶性状的分子标记辅助选育提供参考和依据.