不同成熟期桃品种NAC基因遗传多样性研究

• 作者: 冯涛 刘咲頔 张雪芳 熊怡 罗鑫磊 雷雨
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 桃 NAC转录因子 成熟期 保守区 系统进化树
• 年，卷（期）: 2017,（22）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 46-49
• 页数: 4页
• 分类号: S662.101
• 字数: 3936字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2017.22.011

摘要

从11个桃品种嫩叶中分别提取基因组DNA,根据GDR数据库中NAC基因序列信息,设计特异引物,PCR扩增,对产物克隆测序.然后,使用DNAman软件进行核苷酸和氨基酸序列比对,使用ORF Finder获得开放阅读框和推导氨基酸序列,使用CDD工具进行蛋白质结构域分析,利用Blastp工具搜索同源蛋白,采用Mega软件绘制系统进化树.结果发现,NAC蛋白第16~140位存在1个NAC结构域,N端比较保守,C端则多样性比较高;核苷酸变异有SNP和Indel 2类,津柳早红和小白桃在第3外显子区SNP和Indel变异数量非常多,说明这2个品种的NAC基因结构具有独特性.蛋白比对发现,桃NAC与梅同源性最高,其次是鸭梨;进化树体现了物种的亲缘关系.结果表明,参试品种NAC基因存在比较丰富的遗传多样性,在保守区内的氨基酸变异可能影响蛋白的功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冯涛	天津农学院园艺园林学院	33	187	7.0	13.0
2	雷雨	天津农学院园艺园林学院	3	12	2.0	3.0
3	张雪芳	天津农学院园艺园林学院	1	1	1.0	1.0
4	罗鑫磊	天津农学院园艺园林学院	1	1	1.0	1.0
5	刘咲頔	天津农学院园艺园林学院	1	1	1.0	1.0
6	熊怡	天津农学院园艺园林学院	1	1	1.0	1.0