5种方法提取真菌基因组DNA作为PCR模板效果的比较

• 作者: 付婷婷 吕天佑 张云 徐秉良 李焕宇 李远
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: DNA提取 煤污病菌 CTAB SDS 氯化苄 Chelex-100
• 年，卷（期）: 2017,（16）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 28-35
• 页数: 8页
• 分类号: S-3
• 语种: 中文

摘要

本研究旨在比较CTAB法、改良CTAB法、SDS法、氯化苄法和Chelex-100法提取真菌DNA作为PCR模板的效果,以生长速率、菌落形态差异较大的11个煤污病菌属真菌为研究对象,以核糖体RNA(rRNA)基因中的内转录间隔区(ITS)序列和28S rRNA基因部分序列的扩增率为指标,采用SPSS软件对结果进行方差分析.结果表明,CTAB法和改良CTAB法适用真菌范围最广,分别有7个和9个属真菌的扩增率都大于70％且无显著性差异;氯化苄法和Chelex-100法适用范围居中,分别有6个和8个属真菌的扩增率较高且无显著性差异,扩增率分别大于70％和50％;SDS法适用范围最窄,有6个属真菌的扩增率高于50％且无显著性差异.大多数煤污病菌至少有2种及以上的DNA提取方法能够取得较好的效果,但链丝孢属真菌只有用氯化苄法提取DNA效果最好.采用改良CTAB法结合氯化苄法,能够满足所有供试煤污病菌类群真菌提取基因组DNA用作PCR反应模板的需要.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐秉良	甘肃农业大学植物保护学院	87	837	16.0	23.0
2	李焕宇	甘肃农业大学植物保护学院	4	24	2.0	4.0
3	张云	甘肃农业大学植物保护学院	2	17	1.0	2.0
4	付婷婷	甘肃农业大学植物保护学院	1	16	1.0	1.0
5	吕天佑	甘肃农业大学植物保护学院	1	16	1.0	1.0
6	李远	甘肃农业大学植物保护学院	1	16	1.0	1.0