一种从PAXgene全血RNA管内提取基因组DNA的方法

• 作者: 刘佳缘 周姗姗 徐玉东 杨永清 杨莎莎 王文倩 韩晓杰
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 医学
• 关键词: PAXgene全血RNA管 基因组DNA 提取方法
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 1615-1618,1609
• 页数: 5页
• 分类号: Q751|R-331|R446.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.13241/j.cnki.pmb.2017.09.004

摘要

目的:从同一生物样本同步提取RNA和DNA,能提高样本的利用率,而且对于基因组学、转录组学和表观遗传学检测数据之间的比对和匹配分析也十分重要.本研究在不影响RNA样品制备的前提下,建立一种从PAXgene全血RNA管内提取基因组DNA的方法.方法:取一定量PAXgene全血RNA管血液样本,使用QIAamp DNA试剂盒提取血细胞基因组DNA,系统优化提取过程中的离心参数、洗脱量以及初始血液样本量等实验参数,并对提取的基因组DNA质量进行检测.结果:用PAXgene全血RNA管3mL血液样本能够提取出8.918±1.100μg基因组DNA,紫外分光光度计检测DNA样品的OD 260/280比值为1.89±0.09,琼脂糖凝胶电泳结果显示DNA样品完整无降解.结论:利用本方法提取的DNA样品能够满足下游DNA芯片、DNA甲基化测序等实验要求.该方法有助于从有限的临床血液样本中获取全面的遗传信息,并且提高后续不同实验方法所生成数据之间的可比性和匹配度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐玉东	上海中医药大学上海市针灸经络研究所	26	76	5.0	7.0
2	刘佳缘	上海中医药大学上海市针灸经络研究所	4	6	1.0	2.0
3	王文倩	上海中医药大学上海市针灸经络研究所	7	16	3.0	4.0
4	杨永清	上海中医药大学上海市针灸经络研究所	40	204	7.0	13.0
5	杨莎莎	上海中医药大学上海市针灸经络研究所	2	0	0.0	0.0
6	韩晓杰	上海中医药大学上海市针灸经络研究所	3	8	1.0	2.0
7	周姗姗	上海中医药大学上海市针灸经络研究所	1	0	0.0	0.0