刺五加转录因子基因的挖掘

• 作者: 国红玉 宋菊 尤鹏升 邢朝斌 龙月红
• 来源期刊: 北方园艺
• 学科: 农学
• 关键词: 刺五加 转录组 转录因子 皂苷
• 年，卷（期）: 2017,（20）
• 所属期刊栏目: 中草药
• 页码范围: 153-156
• 页数: 4页
• 分类号: S567.1+9
• 字数: 1930字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11937/bfyy.20170195

摘要

以刺五加嫩叶为试材,采用二代测序方法Illumina HiSeq 4000进行转录组测序和生物信息学方法,找出其转录因子,并随机挑选4个不同家族的转录因子,针对6个生长时期和3个器官的样本,使用实时荧光定量PCR确认转录因子的正确性.结果表明:刺五加转录组共计8.34 Gb,拼接得到77 087条Unigenes,有485个转录因子,分类于36个家族.通过qRT-PCR分析,Unigene 49771、Unigene 22314、Unigene 13139和Unigene18837在不同生长发育时期和器官中表达差异极显著(P＜0.01).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋菊	华北理工大学生命科学学院	8	24	3.0	4.0
2	邢朝斌	华北理工大学生命科学学院	28	59	5.0	6.0
3	国红玉	华北理工大学生命科学学院	10	15	2.0	3.0
4	尤鹏升	华北理工大学生命科学学院	8	14	2.0	3.0
5	龙月红	华北理工大学生命科学学院	17	38	4.0	5.0