太子参2个赤霉素2-氧化酶基因的克隆与序列分析

• 作者: 丁铃 周涛 李军 江维克 肖承鸿 郑伟 龙登凯
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 太子参 赤霉素2-氧化酶 基因克隆 生物信息学分析 基因表达分析
• 年，卷（期）: 2017,（15）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 3145-3152
• 页数: 8页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2017.15.021

摘要

目的 克隆太子参Pseudostellariae Radix赤霉素2-氧化酶(gibberellin2-oxidase,GA2ox)基因,并进行生物信息学和表达分析.方法 通过对太子参转录组数据库的分析,得到2个太子参GA2ox基因PhGA2ox1和PhGA2ox8..采用反转录PCR(RT-PCR)和特异PCR技术获得2个基因的蛋白编码区(coding sequence,CDS),并对其编码的蛋白进行生物信息学分析.采用实时荧光定量PCR (qPCR)检测基因的表达模式.结果 生物信息学分析表明,PhGA2ox1和PhGA2ox8的CDS区分别长981和1 056 bp,编码326和351个氨基酸残基,蛋白相对分子质量分别为36 871.3和40 169.9,理论等电点为8.66和6.91,具有GA2ox的保守结构域DIOX_N和20G-Fell_Oxy,但均无明显疏水区,无跨膜结构域,无信号肽,为稳定蛋白.序列系统进化分析显示植物GA2ox蛋白可被分为3个亚类,PhGA2ox1和PhGA2ox8分别归入Class Ⅰ和Class Ⅲ亚类.qPCR分析显示,PhGA2ox1在不同组织器官中的表达基本恒定,而PhGA2ox8在块根木质部的表达量却显著高于在其他组织器官中的表达量(P＜0.05).结论 首次获得PhGA2ox1和PhGA2ox8基因的编码区序列,为进一步分析2个基因在太子参生长发育过程中的作用奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	江维克		125	792	17.0	20.0
2	周涛		136	997	18.0	23.0
3	李军		52	184	8.0	11.0
4	肖承鸿		58	415	12.0	16.0
5	郑伟		16	45	4.0	6.0
6	龙登凯		11	34	4.0	5.0
7	丁铃		11	59	5.0	7.0