地黄属核基因与叶绿体基因DNA条形码比较研究

• 作者: 刘占林 李建芳 杜优 程芳婷 黄静
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 地黄属 DNA条形码 核基因 叶绿体基因 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 165-171
• 页数: 7页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2017.01.023

摘要

目的 比较单拷贝核基因、叶绿体基因及ITS等DNA条形码在地黄属的物种分辨率,探讨地黄属种间亲缘关系.方法 利用距离法与建树法分析了地黄属植物13个居群的12个单拷贝核基因、6个叶绿体基因以及ITS片段物种鉴定成功率,构建了地黄属系统发育树.结果 叶绿体matk和rbcL、单拷贝核基因物种分辨率普遍较低,多基因联合分析有助于物种鉴定成功率的提高.在NJ树中,地黄-茄叶地黄聚为一支,其他物种都是单系群,裂叶地黄位于系统发育树基部.结论 ITS是地黄属物种鉴定的核心条形码,psbA-tmH、tmL-F、tmM-V、tmS-G可以作为备选方案,核基因RR255与R257可用作地黄专用鉴定条形码.四倍体地黄起源方式有待进一步澄清.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄静	西北大学生命科学学院西部资源生物与现代生物技术教育部重点实验室	6	26	4.0	5.0
2	刘占林	西北大学生命科学学院西部资源生物与现代生物技术教育部重点实验室	8	95	5.0	8.0
3	李建芳	西北大学生命科学学院西部资源生物与现代生物技术教育部重点实验室	3	14	2.0	3.0
4	程芳婷	西北大学生命科学学院西部资源生物与现代生物技术教育部重点实验室	1	4	1.0	1.0
5	杜优	西北大学生命科学学院西部资源生物与现代生物技术教育部重点实验室	1	4	1.0	1.0