辣椒GATA转录因子的生物信息学分析

• 作者: 张春利 袁岐 许向阳 赵婷婷
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 GATA 转录因子 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（17）
• 所属期刊栏目: 生物科学
• 页码范围: 24-31
• 页数: 8页
• 分类号: S641.3
• 语种: 中文

摘要

本研究旨在分析和鉴定辣椒GATA转录因子的家族成员的生物信息学特征,为今后进一步的实验研究奠定基础.利用生物信息学手段,通过HMMER和SMART软件对辣椒GATA转录因子进行鉴定.利用Clustal X 1.83、MEGA5.05、GSDS、MEME等软件对辣椒GATA转录因子进行生物信息学分析.本研究鉴定出24个辣椒GATA转录因子家族成员.系统进化树的结果显示,24个GATA家族成员分为4个亚族.GSDS软件结果表明辣椒GATA转录因子的内含子、外显子分布情况.DNAMAN软件和MEME软件结果显示辣椒的大部分GATA转录因子是保守的.染色体定位软件MapInspect分析表明,辣椒GATA转录因子在辣椒12条染色体上分布并不均匀.本研究鉴定并分析了辣椒GATA转录因子的生物信息学的特征,为以后继续研究其功能提供了一定的理论基础与现实意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许向阳	东北农业大学园艺园林学院	176	1813	20.0	34.0
2	赵婷婷	东北农业大学园艺园林学院	37	74	5.0	7.0
3	袁岐	东北农业大学园艺园林学院	5	4	1.0	2.0
4	张春利	东北农业大学园艺园林学院	5	4	1.0	2.0