五加科植物叶绿体基因组结构与进化分析

• 作者: 宋菊 尹峰 林丽梅 邢朝斌 龙月红
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 五加科 叶绿体基因组 刺五加 人参 三七 穗序鹅掌柴 系统进化
• 年，卷（期）: 2017,（24）
• 所属期刊栏目: 分子生药学专栏
• 页码范围: 5070-5075
• 页数: 6页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2017.24.002

摘要

目的 获取五加科叶绿体基因组的结构特征以及进化关系.方法 以已测序完成的10个属的20种五加科植物叶绿体基因组为研究对象,系统比较基因组间的差异,分析4个IR边界扩张与收缩情况,并以近缘物种当归为外类群,使用MEGA 4.0构建系统进化树,分析物种间的亲缘关系.结果 20种五加科植物的叶绿体基因组大小差异较小,最大差仅1 909bp.各物种均出现基因替换现象,由cemA基因替换ycf10基因,且数量存在一定差异,主要由tRNA引起.通过比较发现,五加科物种的4个IR边界比较保守,仅野三七、三七和穗序鹅掌柴的边界基因进入IR区的长度与其他物种的差异较大.以当归为外类构建的系统进化树,各节点的支持率较高,清晰地反映了各物种间的亲缘关系.结论 叶绿体基因组涵盖的信息量大,可以用于分析关系较近与进化较快物种的系统发生问题.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋菊	华北理工大学生命科学学院	8	24	3.0	4.0
2	林丽梅	华北理工大学生命科学学院	6	11	2.0	3.0
3	邢朝斌	华北理工大学生命科学学院	28	59	5.0	6.0
4	龙月红	华北理工大学生命科学学院	17	38	4.0	5.0
5	尹峰	华北理工大学生命科学学院	5	10	2.0	3.0