丙型肝炎病毒非结构蛋白NS2核酸适配子的筛选

• 作者: 徐国胜 戎霞 王敏 黄可君 黄斯瑜
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: SELEX 丙型肝炎病毒 NS2蛋白 适配子
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 实验研究论著
• 页码范围: 880-883,962
• 页数: 5页
• 分类号: R394.3
• 语种: 中文

摘要

目的 获得与丙型肝炎病毒非结构蛋白NS2特异结合的高亲和力的DNA适配子.方法 应用配基指数富集的系统进化(SELEX)技术进行HCV-NS2蛋白适配子筛选,将筛选得到的适配子克隆测序,应用DNAMAN软件对适配子一级结构和二级结构进行比对分析.结果 重复筛选7轮后,适配子亲和力和特异性都达到最高,克隆测序得到4个适配子序列,命名为A1、A2、A3、A4,其随机序列部分分别为A1:GTGCGTCCCATGCTGCTGACTTA-AATGGGTGGAGGGCAG,A2:CGTGAAATTGTTGACCACTCATGGAATCTGATCTCGTTT,A3:GAAAGGGGATAATCACT-TAGGCCTCTCGAATAGTTTATC,A4:AGAAAGTTGAGAACTGCTGTTATTTTGTTAACGTACATG.经软件分析,适配子之间没有共同保守序列和同源序列,适配子的二级空间结构以茎环和口袋结构为主.结论 获得了能与HCV-NS2蛋白高亲和力和特异性结合的DNA适配子.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	戎霞		47	244	10.0	11.0
2	黄可君		20	110	5.0	9.0
3	徐国胜		14	92	4.0	9.0
4	王敏		21	129	7.0	11.0