青春双歧杆菌ATCC15703I型Sec途径分泌蛋白的预测和功能分析

• 作者: 周金影 张武 张跃华 朱德全
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 医学
• 关键词: 青春双歧杆菌 基因组 分泌蛋白 Sec分泌途径 信号肽
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 136-138,143
• 页数: 4页
• 分类号: R151.3
• 字数: 1809字
• 语种: 中文

摘要

[目的]对青春双歧杆菌分泌蛋白进行预测和功能分析,为分析该菌胞外蛋白的分泌机制和功能打下基础.[方法]以青春双歧杆菌代表菌株ATCC15703基因组编码蛋白序列为研究对象,采用 SignalP 4.0和TMHMM 2.0 软件分析该菌株的I型Sec途径分泌蛋白,同时采用COG功能数据库(Cluster of Orthologous Groups of proteins)对预测的这类分泌蛋白进行功能分析.[结果]青春双歧杆菌ATCC15703的1 648个蛋白中有91个被I 型(Spase I)信号肽酶识别的I型Sec途径分泌蛋白,分泌蛋白的信号肽长度最大的有54个氨基酸,最小的有11个氨基酸.I 型Sec途径分泌蛋白的功能分析结果显示,分泌蛋白主要参与碳水化合物代谢与转运,氨基酸代谢与转运,复制、重组和修复,以及无机离子代谢和转运.[结论]青春双歧杆菌I型Sec途径分泌蛋白的预测和功能分析为了解该菌胞外蛋白的分泌机制提供了数据基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张跃华	佳木斯大学理学院	103	364	8.0	15.0
5	朱德全	佳木斯大学理学院	65	156	7.0	9.0
9	张武	佳木斯大学理学院	58	176	7.0	11.0
10	周金影	佳木斯大学生命科学学院	2	1	1.0	1.0