真菌灰树花菌丝体转录组测序及分析

• 作者: 吴天祥 聂文强 芦红云 钟敏
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 灰树花 菌丝体 转录组测序 功能注释
• 年，卷（期）: 2017,（20）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 6-11
• 页数: 6页
• 分类号: Q939.99
• 字数: 4692字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7506/spkx1002-6630-201720002

摘要

灰树花多糖具有抗肿瘤、抗HIV、抗氧化等作用,为探明灰树花多糖合成的遗传基础,采用Illumina高通量测序技术对灰树花转录组进行测序,获得74 575 910个reads,10.4 G数据量;将测序数据进行de novo拼接后得到18 077个Unigene.对所得Unigene进行不同数据库比对,在Nr数据库中有11 651个Unigene被注释到,其中灰树花转录组与变色栓菌相似序列最多(18.74％);有8 332个Unigene在GO数据库中注释到,分为细胞组分、分子功能及生物学过程等3大类59个分支;与KEGG数据库比对,共有5 200个Unigene被注释,分属376条代谢通路.从18 077个Unigene中共找到1 155个简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)位点,其中单核苷酸重复最高,六核苷酸重复最少,A/T出现频率最高.本研究中在KEGG数据库注释到115个Unigene与灰树花多糖合成有关,这些Unigene及其注释信息为今后深入开展灰树花多糖代谢途径及相关功能基因等研究提供了依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴天祥	贵州大学酿酒与食品工程学院	101	785	15.0	22.0
5	聂文强	贵州大学酿酒与食品工程学院	6	24	3.0	4.0
6	钟敏	贵州大学酿酒与食品工程学院	5	23	3.0	4.0
7	芦红云	贵州大学酿酒与食品工程学院	5	23	3.0	4.0