利用TCGA和GEO公共数据集分析GSR在胃癌中的表达及其临床意义

• 作者: 兰庆芝 王琪 董卫国 马静静
• 来源期刊: 中国医师杂志
• 关键词: 染色体图 肿瘤/遗传学 基因表达谱 谷胱甘肽还原酶/代谢 胃肿瘤/代谢
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1014-1017
• 页数: 4页
• 字数: 2769字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1008-1372.2017.07.014

摘要

目的 通过癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据集和基因表达汇编(GEO)数据库探索谷胱甘肽还原酶(GSR)在胃癌中的表达情况,研究GSR与胃癌临床病理特征的联系,分析GSR与其他生物通路的关系,推测GSR对评价胃癌患者预后的意义,探讨GSR在胃癌发生发展过程中的作用.方法 检索TCGA中的胃癌数据集并下载,结合临床信息对芯片数据进行分析.对肿瘤样本进行基因富集分析从而发现与GSR相关的生物学通路.结果 GSR在不同美国肿瘤研究联合委员会(AJCC)T分期中的表达水平差异有统计学意义(P＜0.01).在不同年龄、性别、肿瘤最短径、AJCC M分期、有无Barrett食管、有无胃癌家族史、有无幽门螺杆菌(HP)感染中的表达量则差异无统计学意义(P＞0.05).GSR高表达患者的无病生存期及总生存期均比GSR低表达患者更长(P＜0.05).GSR高表达的肿瘤样本富集了与氧化磷酸化、核苷酸代谢、蛋白进入线粒体过程、有丝分裂周期调控等生物学通路的基因.结论 GSR可以作为潜在的判断胃癌患者预后的指标及治疗胃癌的靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	董卫国	武汉大学人民医院消化内科	273	1416	17.0	24.0
2	马静静	武汉大学人民医院消化内科	20	57	4.0	6.0
3	王琪	青岛大学附属医院肿瘤科	13	13	1.0	3.0
4	兰庆芝	武汉大学人民医院消化内科	3	9	1.0	3.0