植物乳杆菌LY-78乳酸脱氢酶基因的生物信息学分析

• 作者: 孙大庆 张丽萍 李芬
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 植物乳杆菌 乳酸脱氢酶 苯乳酸 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（8）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 102-106
• 页数: 5页
• 分类号: Q819
• 字数: 4211字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7506/spkx1002-6630-201708017

摘要

目的:探究植物乳杆菌LY-78菌株全部5个乳酸脱氢酶基因及其编码蛋白质的结构和功能.方法:应用多种生物信息学软件对植物乳杆菌LY-78菌株的5个乳酸脱氢酶基因及氨基酸序列进行结构分析和功能预测.结果:植物乳杆菌LY-78中5个乳酸脱氢酶的核苷酸及氨基酸序列均具有较高的保守性,均为位于细胞质的热稳定性、非分泌、非跨膜蛋白,除了ldhL3基因,其余4个基因均具有各自高度保守的功能位点和结构域,均存在典型的烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(nicotinamide adenine dinucleotide,NAD+)结合位点序列GXGXXG.结论:乳酸脱氢酶D1 (D1-lactate dehydrogenase,D1-LDH)、D2-LDH、L1-LDH及L2-LDH均具有完整的功能位点和结构域,很可能具有真正的乳酸脱氢酶活性,L3-LDH由于缺失NAD+结合结构域和功能位点,因而可能不具有乳酸脱氢酶活性,这些分析结果为今后植物乳杆菌乳酸脱氢酶基因改造和苯乳酸合成代谢机制研究提供了必要的理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张丽萍	黑龙江八一农垦大学食品学院	244	1354	17.0	27.0
3	孙大庆	黑龙江八一农垦大学食品学院	26	73	5.0	6.0
7	李芬	黑龙江八一农垦大学食品学院	9	24	3.0	4.0