象草CpCCoAOMT2基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘智微 吴娟子 张建丽 钟小仙 钱晨 顾洪如
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 象草 咖啡酰酸辅酶A-O-甲基转移酶 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2017,（16）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 33-37
• 页数: 5页
• 分类号: Q785
• 字数: 3480字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2017.16.007

摘要

从象草中克隆了CpCCoAOMT2基因,并对其进行了初步的生物信息学分析.利用转录组测序获得的表达序列信息,设计1对特异性的PCR引物,应用RT-PCR技术从象草中扩增出CpCCoAOMT2基因.对获得的基因进行序列同源性搜索、结构域搜索及3D结构预测、分子系统进化树构建等生物信息学分析.测序结果表明,CCoAOMT2基因全长926 bp,含110 bp的5'-UTR、741 bp的CDS和75 bp的3'-UTR,共编码246个氨基酸,GenBank登录号为BankIt1975804;Blastn和BlastT分析结果显示,CpCCoAOMT2基因及其编码的蛋白在核苷酸水平和氨基酸水平上与多种植物的CCoAOMT基因和CCoAOMT蛋白具同源性;预测CpCCoAOMT2蛋白相对分子质量为27 253,等电点为5.08,是一个不含跨膜结构域、不含信号肽分子的亲水性、稳定蛋白.分子进化树分析结果表明,CpCCoAOMT2蛋白与禾本科植物的CCoAOMT蛋白亲缘关系最近,与裸子植物和蕨类植物关系较近,而与双子叶植物的关系较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	顾洪如	江苏省农业科学院畜牧研究所	130	1480	19.0	29.0
2	钟小仙	江苏省农业科学院畜牧研究所	77	709	16.0	21.0
3	吴娟子	江苏省农业科学院畜牧研究所	17	50	4.0	5.0
4	张建丽	江苏省农业科学院畜牧研究所	21	127	7.0	10.0
5	刘智微	江苏省农业科学院畜牧研究所	18	89	6.0	8.0
6	钱晨	江苏省农业科学院畜牧研究所	7	11	2.0	2.0