葡萄白藜芦醇合酶基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 刘钦松 吴永坤 张念强 石党委 祁庆生 翟逸 马云
• 来源期刊: 食品工业科技
• 学科: 工学
• 关键词: 葡萄 白藜芦醇合酶 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2017,（19）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 96-99
• 页数: 4页
• 分类号: TS201.3
• 字数: 2380字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13386/j.issn1002-0306.2017.19.018

摘要

以葡萄总RNA为模板,利用RT-PCR的方法从葡萄中扩增获得一条白藜芦醇合酶基因完整的cDNA序列,命名为RS.利用生物信息学软件对其核酸和蛋白质序列进行分析,结果表明,该序列长1179 bp,与已报道的葡萄白藜芦醇合酶基因的序列相似性达到94％ ～99％,氨基酸序列相似性为96％ ～99％;RS基因编码392个氨基酸,氨基酸序列含有完整的芪合酶家族的特征序列GVLFGPGLT和活性中心序列GCYAGGTVLR;预测的分子量为42.78 kDa,理论等电点为6.57,不稳定参数为35.92,在分类上属于稳定性蛋白;二级结构主要以α-螺旋、无规则卷曲以及β-折叠为主,其中α-螺旋含量为44.13％、无规则卷曲含量为26.53％,β-折叠含量为17.66％.