亚硝化单胞菌is79a3 Sec途径分泌系统及底物蛋白分析

• 作者: 张武 张跃华 朱德全 温馨 王纯岩
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 亚硝化单胞菌 分泌蛋白 分泌途径 功能分析
• 年，卷（期）: 2017,（29）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 153-154,206
• 页数: 3页
• 分类号: S188
• 字数: 2271字
• 语种: 中文

摘要

[目的]分析亚硝化单胞菌is79a3 Sec途径分泌装置及底物蛋白.[方法]从NCBI中选取亚硝化单胞菌is79a3菌株基因组注释的蛋白质氨基酸序列,采用Blast程序搜寻基因组中编码Sec途径分泌装置的蛋白,同时采用SignalP 4.0、LipoP、TMHMM 2.0软件分析该菌株基因组中Sec途径的底物蛋白,同时采用COG功能数据库进行功能分析.[结果]通过分析发现亚硝化单胞菌is79a3菌株编码Sec途径分泌装置有关的蛋白15个,包含Sec途径分泌系统中12个转运蛋白编码基因,1个信号肽识别蛋白编码基因和2个信号肽酶蛋白编码基因;Sec途径底物蛋白分析结果显示366个含有Sec途径Spase I类肽酶识别的信号肽,36个蛋白只含有Spase II类肽酶识别的信号肽.402个Sec途径底物蛋白功能分析结果显示:有272个蛋白功能不清楚,130个蛋白有具体的功能注释.[结论]亚硝化单胞菌is79a3 Sec途径分泌装置完整,该菌株Sec途径底物蛋白大多数没有功能注释和功能未知,在有功能注释的蛋白中,主要参与细胞壁/细胞膜的生物合成、蛋白质翻译后修饰/蛋白更替、无机离子转运代谢、能源产生与转换.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张跃华	佳木斯大学理学院	103	364	8.0	15.0
2	朱德全	佳木斯大学理学院	65	156	7.0	9.0
3	张武	佳木斯大学理学院	58	176	7.0	11.0
4	王纯岩	佳木斯大学理学院	20	69	5.0	7.0
5	温馨	佳木斯大学理学院	7	16	2.0	3.0