黄芪甲基化敏感扩增多态性(MSAP)扩增引物筛选及初步应用

• 作者: 周莉质 夏泉 宗凯 宫鹏 李秀秀 赵营莉
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 黄芪 甲基化敏感扩增多态性 选择性扩增 聚类分析
• 年，卷（期）: 2017,（29）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 149-152
• 页数: 4页
• 分类号: S188
• 字数: 2856字
• 语种: 中文

摘要

[目的]建立并优化黄芪甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术扩增反应体系,对中药材黄芪甲基化水平进行研究.[方法]磁珠法提取黄芪DNA后,采用Hpa II/Msp I 2种内切酶进行酶切,将酶切产物加上连接接头序列,经预扩增和选择性扩增反应,最终从黄芪MSAP的256对引物中筛选出最佳分辨引物4对.应用筛选到的4对引物,分析12种不同产地黄芪的甲基化模式,并对甲基化水平聚类分析.[结果]经MSAP检测12个黄芪样本半甲基化率在12.5%~26.7%,全甲基化率在25.6%~51.1%,总甲基化率在48.7%~73.5%,总体上黄芪样本的全甲基化率大于半甲基化率.采用NTSYSpc软件对黄芪样品Hpa II和Msp I多态性数据进行分析,获得UP-GMA聚类图和主成分分析PCA图.[结论]MSAP技术能够很好地用于黄芪的甲基化分析,结合NTSYSpc软件能对不同产地黄芪之间甲基化水平进行聚类分析,且初步分析结果表明从UPGMA和PCA图上来看,地区相近的单株聚类分析表现出了一定的地域性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	夏泉	安徽医科大学第一附属医院药剂科	102	1638	20.0	38.0
2	宫鹏	安徽医科大学第一附属医院药剂科	13	38	4.0	5.0
3	宗凯		18	74	4.0	8.0
4	赵营莉	安徽医科大学第一附属医院药剂科	2	13	1.0	2.0
5	周莉质		4	5	2.0	2.0
6	李秀秀		1	0	0.0	0.0