我国小反刍兽疫病毒H基因序列分析

• 作者: 刘永宏 张保军 张路瑶 李岳洋 李飞 蒋秀梅 赵丽 马世强 马海璐
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 小反刍兽疫 H基因 序列分析 核苷酸同源性 氨基酸同源性
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医与水产蚕桑
• 页码范围: 149-152,158
• 页数: 5页
• 分类号: S855.3
• 字数: 4777字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2017.07.040

摘要

为了分析我国小反刍兽疫疫情的特点,从GenBank下载我国和其他国家小反刍兽疫病毒(PPRV)毒株H基因全序列,应用分子生物学软件DNAStar进行序列分析.结果显示,始于2007年的我国首次PPR疫情中,我国西藏地区PPRV 各毒株间H基因核苷酸同源性介于99.6%~100.0%之间,我国西藏与其他国家PPRV毒株核苷酸同源性介于86.7%~98.3%之间;我国西藏地区PPRV毒株间氨基酸序列同源性介于99.7%~100.0%之间,我国西藏与其他国家PPRV毒株氨基酸序列同源性介于89.3%~98.4%之间.始于2013年年底的我国又一次PPR疫情中,我国PPRV毒株间核苷酸同源性介于99.7%~99.8%之间,我国与其他国家PPRV毒株核苷酸同源性介于87.2%~97.5%之间;我国PPRV毒株间氨基酸序列同源性介于99.2%~99.8%之间,我国与其他国家PPRV毒株氨基酸序列同源性介于89.0%~98.4%之间.H基因进化树分析结果显示,我国的9株PPRV划分为基因Ⅳ系.我国PPRV毒株与印度毒株及土耳其毒株同源性最高,可能由这2个国家传入我国.