动物双歧杆菌AD011细胞壁蛋白的预测和功能分析

• 作者: 刘向东 卢伟 姚嘉 张跃华 朱德全 栾积毅 王茗悦 韩诚武
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 两歧双歧杆菌 基因组 细胞壁蛋白 功能
• 年，卷（期）: 2017,（8）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 159-160
• 页数: 2页
• 分类号: S852.6
• 字数: 1487字
• 语种: 中文

摘要

[目的]运用生物信息学方法预测动物双歧杆菌AD011锚定于细胞壁的蛋白并进行功能分析,为后续研究该菌与宿主相互作用的分子机制提供基础资料.[方法]用Phobius和SignalP 4.0软件对动物双歧杆菌AD011全基因组编码蛋白中细胞壁蛋白进行预测,同时采用COG (Cluster of Orthologous Groups of proteins)功能数据库对预测的细胞壁蛋白进行功能注释和聚类分析.[结果]动物双歧杆菌AD011基因组1 518个编码蛋白中,11个蛋白含有细胞壁的锚定基序,6个蛋白含有LP×TG基序,1个蛋白含有LysM基序,1个蛋白含有PG结合区域,2个蛋白含有SLH结构域,1个蛋白含有NLPC_P60结构域.细胞壁蛋白功能分析结果显示,11个细胞壁蛋白中,9个蛋白没有功能注释,2个蛋白(NLP/P60 protein和1,4-beta-N-acetylmuramidase)参与细胞壁和细胞膜的生物合成.[结论]动物双歧杆菌AD011大多数细胞壁蛋白功能未知,还需在以后的研究中进行进一步的功能注释.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姚嘉	佳木斯大学机械工程学院	43	152	5.0	10.0
2	卢伟	佳木斯大学机械工程学院	43	201	7.0	12.0
3	栾积毅	佳木斯大学机械工程学院	37	105	5.0	8.0
4	张跃华	佳木斯大学理学院	103	364	8.0	15.0
5	朱德全	佳木斯大学理学院	65	156	7.0	9.0
6	韩诚武	佳木斯大学生命科学学院	34	65	5.0	6.0
7	刘向东	佳木斯大学机械工程学院	42	155	7.0	10.0
8	王茗悦	佳木斯大学生命科学学院	5	0	0.0	0.0