动物双歧杆菌AD011表面脂蛋白的全基因组预测和功能分析

• 作者: 于陆雪子 周博 周金影 张宛麟 朱德全 栗金柳 王茗悦 郝莹莹 高峰
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 工学
• 关键词: 动物双歧杆菌 基因组 脂蛋白 信号肽
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 117-118
• 页数: 2页
• 分类号: TS201.3
• 字数: 1382字
• 语种: 中文

摘要

[目的]运用生物信息学方法预测动物双歧杆菌AD011定位于细胞膜的表面脂蛋白,为后续研究该菌与宿主相互作用的分子机制提供基础资料.[方法]用SignalP 4.0和LipoP软件对动物双歧杆菌AD011全基因组编码蛋白中表面脂蛋白和信号肽进行预测,同时采用COG 功能数据库对预测的脂蛋白进行功能注释和聚类分析.[结果]对动物双歧杆菌AD011基因组1 518个蛋白的表面脂蛋白预测,结果表明,19个蛋白具有脂蛋白信号肽.功能分析显示,该菌株19个脂蛋白中有3个蛋白没有功能注释,16个蛋白有功能注释,其中10个蛋白参与氨基酸代谢与转运、3个蛋白参与碳水化合物代谢与转运,3个蛋白参与无机盐离子代谢与转运.[结论]动物双歧杆菌AD011表面脂蛋白参与的功能主要与营养物质的转运和代谢有关.