利用SCoT标记对福建茶树资源进行分析,构建适用于福建茶树资源SCoT-PCR扩增体系.从38条SCoT引物中筛选出的16条多态性引物,构建了55份茶树品种(系)的SCoT标记指纹图谱.对55份材料共扩增出219条条带,多态性条带为216条,平均每条引物扩增出13.8条,多态性比率PPB为93.15%,55份供试材料的遗传相似系数(Genetic similarity, GS)介于0.49~0.85,平均为0.67.SCoT标记分析55份供试材料共两个群体的观测等位基因数 Na 为1.93,有效等位基因数 Ne 为1.54,Nei 基因多样性为0.32,香农指数 Shannon 为0.48,遗传分化Gst为0.067,基因流Nm为7.01.在遗传相似系数为0.64处,将55份茶树资源分成2大类.