miR-450基因家族进化分析及其在沙子岭猪睾丸组织表达量分析

• 作者: 冉茂良 彭馥芝 翁波 董莲花 陈斌
• 来源期刊: 经济动物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 沙子岭猪 miR-450 进化 定量表达
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 10-16
• 页数: 7页
• 分类号: Q786
• 语种: 中文
• DOI: 10.13326/j.jea.2017.1212

摘要

为探明miR-450基因家族(miR-450s)的系统进化历程及其在沙子岭猪睾丸组织不同发育时期表达规律.通过miRBase数据库检索miR-450s序列,利用Ensembl数据库信息确定miR-450s在不同物种中的基因组定位,采用MEGA 6.0构建miR-450基因家族的系统进化树,并利用RT-qPCR检测miR-450s在沙子岭猪睾丸组织不同发育期(E90、D1、D30、D60、D90、D120、D150、D180)的表达变化.miRBase数据库共检索15个物种36条miR-450s序列,且miR-450s序列具有高度保守性.基因组定位显示miR-450s位于X染色体上,均位于基因间隔区(Intergenic region,IGR),且miR-450基因家族成员在进化过程中紧密相连,可能由于串联重复所致.RT-qPCR结果显示,miR-450s在胚胎期中表达量显著高于出生后表达量(P＜0.01),且miR-450基因家族3个成员(miR-450a、miR-450b、miR-450c)在沙子岭猪睾丸不同发育阶段呈现出协同表达的特性.miR-450基因家族可能在猪睾丸组织发育过程中发挥重要调控作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	翁波	湖南农业大学动物科学技术学院	33	88	5.0	8.0
3	冉茂良	湖南农业大学动物科学技术学院	23	204	6.0	14.0
5	董莲花	湖南农业大学动物科学技术学院	15	35	3.0	5.0
9	彭馥芝	湖南农业大学动物科学技术学院	8	23	3.0	4.0