牛源防御素类抗菌肽的生物信息学分析

• 作者: 张慧辉 张炜 徐彦召 杭柏林 胡建和 胡斌 董萌萌
• 来源期刊: 现代畜牧兽医
• 学科: 生物学
• 关键词: 牛 防御素 抗菌肽 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（7）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 1-9
• 页数: 9页
• 分类号: Q51
• 字数: 3362字
• 语种: 中文

摘要

为研究牛源防御素类抗菌肽的生物学功能,本研究利用ProtParam工具分析了抗菌肽的理化性质,利用SOPMA分析了抗菌肽的二级结构,利用NetOGlyc 4.0 Server分析了抗菌肽的糖基化,利用NetPhos 3.1 Server分析了抗菌肽的磷酸化,利用Target P 1.1 Server分析了抗菌肽的亚细胞内定位.结果表明,牛源防御素类抗菌肽为阳离子型抗菌肽,等电点在9.31～11.20之间;TAP、bBD-1、BNBD2、BNBD3、BNBD7、BNBD8和BNBD9为稳定性多肽,其他牛源防御素类抗菌肽为不稳定多肽;BNBD12和BNBD13为疏水性多肽,其他牛源防御素类抗菌肽为亲水性多肽;TAP、LAP、bBD-1、BNBD2、BNBD3、BNBD4、BNBD6、BNBD7、BNBD8和BNBD10由α螺旋、β折叠、β转角和无规则卷曲构成,EBD、BNBD1、BNBD5、BNBD11、BNBD12和BNBD13由β折叠、β转角和无规则卷曲构成;没有糖基化位点,除了BNBD7不存在磷酸化位点外,其他16种防御素类抗菌肽存在丝氨酸和苏氨酸的磷酸化位点,但不存在酪氨酸的磷酸化位点.根据分析结果推测牛源防御素类抗菌肽可作用于细胞壁或细胞膜,从而导致细菌死亡.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张炜	河南科技学院动物科技学院	19	43	3.0	6.0
2	杭柏林	河南科技学院动物科技学院	136	530	12.0	18.0
3	胡建和	河南科技学院动物科技学院	140	452	10.0	15.0
4	张慧辉	河南科技学院动物科技学院	41	162	7.0	11.0
5	胡斌	河南科技学院动物科技学院	33	88	6.0	7.0
6	徐彦召	河南科技学院动物科技学院	48	109	5.0	8.0
7	董萌萌	河南科技学院动物科技学院	10	12	2.0	3.0