大口黑鲈载脂蛋白基因序列单核苷酸多态性及与生长性状相关分析

• 作者: 吴建开 孙建国 景燕娟 李胜杰 白俊杰 费志平
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大口黑鲈 单核苷酸多态性(SNP) 载脂蛋白 基因型 关联分析
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 132-139
• 页数: 8页
• 分类号: S917|Q753
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2018.01.014

摘要

载脂蛋白(apoprotein,Apo)是血浆脂蛋白的重要组分,参与调节酶活性、脂肪运输与吸收和能量储存.为了探讨Apo基因多态性与大口黑鲈(icropterus salmoides)生长性状的相关性,本研究根据大口黑鲈EST库中ApoA1、ApoA4和ApoC1基因设计引物扩增这3个基因的DNA片段,采用直接测序法和序列比对在ApoA1基因上筛选到1个颠换单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点(A+489C),在ApoC1上筛选到2个颠换SNP位点(A+24G和A+75C),在ApoA4上筛选到1个转换SNP位点(A+633T).利用SnaPshot分型技术对从同批次繁殖和同塘养殖的大口黑鲈群体中随机选取的159尾鱼中的4个SNPs位点进行基因型检测,统计分析显示,4个位点在所检测大口黑鲈群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态,且ApoA4基因上的A+633T和ApoC1基因上的A+24G和A+75C位点在群体中的基因型和等位基因频率一致,3个位点完全连锁.运用软件Spss 15.0中的一般线性模型对4个SNPs位点与大口黑鲈全长、体高和体质量进行关联分析,结果表明,ApoA1基因上的A+489C位点的3种不同基因型大口黑鲈在体质量和体高性状方面的差异显著(P＜0.05);ApoA4基因上的A+633T位点和ApoC1基因上的A+24G和A+75C位点与生长性状的关联分析结果一致,不同基因型个体在全长、体高和体质量性状上的差异显著(P＜0.05).A+489C、A+633T、A+24G和A+75C均与大口黑鲈生长性状显著相关,可作为大口黑鲈分子标记辅助选育研究的重要候选标记,应用于后续的分子辅助育种实践中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙建国		5	15	3.0	3.0
2	吴建开		1	5	1.0	1.0