基于线粒体DNA D-loop序列的黄斑篮子鱼群体遗传多样性分析

• 作者: 李文俊 李涛 杨育凯 林黑着 虞为 黄小林 黄忠
• 来源期刊: 热带海洋学报
• 关键词: 线粒体DNA D-loop 黄斑篮子鱼 群体遗传多样性
• 年，卷（期）: 2018,（4）
• 所属期刊栏目: 海洋生物学
• 页码范围: 45-51
• 页数: 7页
• 分类号: P735.541
• 语种: 中文
• DOI: 10.11978/2017109

摘要

对中国华南沿海不同地理群体的黄斑篮子鱼(Siganus oramin)进行遗传多样性分析, 测定了漳州东山湾(DS)、深圳大亚湾(DY)、深圳大鹏湾(DP)、阳江沙扒湾(SB) 4个群体共计100尾黄斑篮子鱼线粒体DNA D-loop序列.结果显示: 序列长度约828bp, 包含72个变异位点, 50个单倍型, A、T、C、G含量平均为31.2%、31.1%、20.8%和16.9%; 单倍型多样性指数为0.893±0.053~0.957±0.030, 核苷酸多样性指数为0.0105±0.0031~0.0179±0.0031, 表现为高单倍型多样性而低核苷酸多样性的特点; 群体内的遗传距离0.0107~0.0184, 群体间的遗传距离0.0112~0.0172, AMOVA分析显示群体间的分子变异占0.66%, 群体内占99.34%; 中性检验结果表明Fu's Fs检验值为显著的负值(-16.7079, p<0.01); 核苷酸不配对分布图呈单峰, 表明黄斑篮子鱼演化过程中经历过种群扩张事件, 推测扩张时间约在 1.38~4.60 万年前.综上, 华南沿海岸4个黄斑篮子鱼群体间不存在显著的遗传分化, 可划归一个管理单元, 而沙扒湾(SB)群体遗传多样性水平相对较高, 应优先加以保护.