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氮素胁迫对水稻根系影响的转录组分析
氮素胁迫对水稻根系影响的转录组分析
作者:
关贤交
刘光荣
彭春瑞
李瑶
邱才飞
邵彩虹
钱银飞
陈先茂
陈金
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
水稻
根系
氮素胁迫
转录组
摘要:
养分胁迫会直接影响水稻的生长发育,相对于地上部分,根系往往较早感知环境胁迫.为了研究水稻根系对养分胁迫响应的分子机制,通过Illumina Hiseq2000平台测序,对氮素胁迫下水稻根系转录基因表达情况进行分析.结果表明,氮素胁迫诱导根系出现了2270个差异转录基因,其中上调表达的有1176个,下调表达的有1094个.采用GO功能分类和Pathway功能注释,可将注释的基因划分为48个功能类别118条代谢途径,包括糖酵解、脂肪酸代谢、氧化磷酸化、氨基酸代谢、淀粉蔗糖代谢等生物学过程.部分根系关键基因表达变化表明,氮素胁迫诱导大量新生蛋白质合成,形成各种酶类,促进新RNA合成,从而形成了更多的新生蛋白质.氮素胁迫诱导根系IAA积累更多来自极性运输,参与植物细胞伸长发育的EGase基因及木质素特异合成途径的关键酶(CCR)表达量发生上调,这些转录基因表达量的变化是根系受养分胁迫刺激而发生了伸长生长的内在机制.
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文献信息
篇名
氮素胁迫对水稻根系影响的转录组分析
来源期刊
华北农学报
学科
农学
关键词
水稻
根系
氮素胁迫
转录组
年,卷(期)
2018,(1)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
168-175
页数
8页
分类号
S141|Q945.12|S511.03
字数
5565字
语种
中文
DOI
10.7668/hbnxb.2018.01.025
五维指标
传播情况
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引文网络
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水稻
根系
氮素胁迫
转录组
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
华北农学报
主办单位:
河北
北京
天津
山西
河南
内蒙古六省市农科院农学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-7091
CN:
13-1101/S
开本:
大16开
出版地:
石家庄市和平西路598号
邮发代号:
18-10
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
6276
总下载数(次)
4
总被引数(次)
88357
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华北农学报2018年第6期
华北农学报2018年第5期
华北农学报2018年第4期
华北农学报2018年第3期
华北农学报2018年第2期
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