甜樱桃成花相关MADS-box基因的克隆及表达分析

• 作者: 倪杨 周宇 张开春 张晓明 段续伟 王晶 闫国华
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甜樱桃 MADS-box家族基因 信息学分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 20-31
• 页数: 12页
• 分类号: S662.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20170204

摘要

[目的]克隆甜樱桃中可能参与成花途径的MADS基因,分析其基本信息,研究其在不同组织中的表达情况.[方法]以甜樱桃‘萨米特’(‘Summit’)为试材,结合桃基因组分析,克隆得到14个可能参与成花的MADS基因,分别命名为PaSOC1、PaAG、PaAP1、PaAP1-2、PaAP3、PaPI、PaSVP、PaAGL24、PaSEP1、PaSEP2、PaSEP3、PaSEP4、PaSEP5、PaFLC,通过DNAMAN、SMART、protein BLAST和MEGA5等软件分析14个甜樱桃的MADS基因结构、氨基酸结构域及其进化关系,RT-PCR检测其在樱桃根、叶芽、叶、花芽、花、韧皮部中的表达模式.[结果]14个甜樱桃MADS成员大小为612～765 bp,均含有典型的MADS结构域和K-box结构域,含有6～8个内含子.分属7个亚组,PaSEP1、PaSEP2、PaSEP3、PaSEP4、PaSEP5属于SEP亚组,PaAP1、PaAP1-2属于AP1亚组,PaAG属于AG亚组,PaSOC1属于SOC1亚组,PaAP3和Pai1属于AP3/PI亚组,PaSVP属于SVP亚组,PaAGL24属于AGL24亚组,PaFLC并未聚到FLC亚组中.RT-PCR分析显示,14个MADS基因在花芽或花中均有不同程度的表达,此外,除PaAP3、PaSEP1、PaSEP4及PaSEP5之外,其他几个基因在韧皮部中也有不同程度的表达.[结论]获得的甜樱桃MADS-box基因结构高度保守,参与调控成花及花发育过程.