乌鳢β-肌动蛋白cDNA克隆与表达分析

• 作者: 文正勇 李锐 王均 袁登越 覃川杰 贺扬 邹远超
• 来源期刊: 四川师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 乌鳢 β-肌动蛋白 系统发育分析 组织表达
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 基础理论
• 页码范围: 690-696
• 页数: 7页
• 分类号: S917.4
• 字数: 5236字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-8395.2018.05.020

摘要

利用RT-PCR技术首次克隆获得了乌鳢(Channa argus)的β-肌动蛋白基因cDNA序列.结果显示,乌鳢β-肌动蛋白的cDNA序列全长1813 bp,包含一个1125 bp的开放阅读框(ORF),共编码375个氨基酸.蛋白序列分析显示,乌鳢β-肌动蛋白的相对分子质量为41.731 kDa,等电点PI为5.16,由20种氨基酸组成(甘氨酸数目占比最高为7.73％,色氨酸数目占比最低为1.07％),含有3个actin信号位点.蛋白同源性分析显示,乌鳢β-肌动蛋白与大西洋鲑、虹鳟、莫桑比克罗非鱼的同源性达99％以上,与非洲爪蟾、鸡和人等脊椎动物的同源性达98％以上,表明β-肌动蛋白基因在不同物种之间具有很高的保守性.基于NJ法的β-actin基因系统发育分析显示,乌鳢处于鲈形目和鲑形目鱼类的基部,并没有与鲈形目鱼类聚类为一支,表明乌鳢β-actin基因的进化速率较其他鲈形目鱼类更慢.组织表达分析显示,乌鳢β-actin在检测的11个组织中均有表达,且表达量比较稳定,表明该基因可作为内参选择时的候选基因,可为乌鳢功能基因研究时的内参选择提供参考.