苏云金芽胞杆菌Sigma54和CcpA共同调控的基因鉴定

• 作者: 宋福平 张杰 彭琦 程海舰
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 苏云金芽胞杆菌 Sigma54 CcpA 转录调控
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 380-390
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20170184

摘要

[目的]通过综合分析苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis) HD73菌株Sigma54缺失突变体的转录组数据和蜡样芽胞杆菌(Bacillus cereus) ATCC 14579菌株CcpA缺失突变体的转录组数据,并进行启动子与CcpA蛋白的体外结合验证,明确Bt HD73菌株中Sigma54和CcpA共同调控的基因,丰富了对微生物的代谢调控网络的认识.[方法]以转录组测序结果为基础,通过基因同源性的比对在Bt HD73菌株中寻找受Sigma54和CcpA共同调控的基因,在这些基因中找到具有cre序列的启动子,通过凝胶阻滞验证这些启动子与CcpA蛋白的结合.[结果]Bt HD73菌株中有31个基因受Sigma54和CcpA共同调控,其中14个基因的启动子序列包含cre序列,这些启动子都可以与CcpA蛋白发生体外结合.[结论]Bt HD73菌株中有14个基因直接受CcpA的调控,同时其转录受Sigma54的控制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张杰	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	165	1879	22.0	38.0
2	宋福平	东北农业大学生命科学学院	51	535	14.0	20.0
4	彭琦	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	5	15	2.0	3.0
7	程海舰	东北农业大学生命科学学院	1	4	1.0	1.0