基于反向分子对接的E-低聚白藜芦醇化合物杀菌机制研究

• 作者: 刘坤 吕碧玉 尹卫平 杨强强 郑莹杰
• 来源期刊: 计算生物学
• 学科: 医学
• 关键词: E-低聚白藜芦醇化合物 天然产物 杀菌机制 反向分子对接
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 页码范围: 41-48
• 页数: 8页
• 分类号: R28

摘要

利用反向分子对接方法对E-低聚白藜芦醇化合物的杀菌机理进行研究。通过受体的直接药物设计方法,筛选得到来自MRSA的PBP2a蛋白(PDB ID:4CJN)匹配度最高的为对接受体蛋白。基于靶蛋白药效团模型与万古霉素的研究比较,结果显示E-低聚白藜芦醇化合物似糖肽类抗生素发挥抗菌杀菌作用,是具抗生素潜能的天然产物。研究揭示了小分子探针的潜在靶标蛋白的搜寻及配体-受体的反向对接,可有效应用于新药先导化合物的筛选研究中。