miRNAs参与养血柔肝法治疗骨关节炎的生物信息学分析

• 作者: 丁立 庞坚 熊轶喆 石印玉 高宁阳
• 来源期刊: 大连医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: miRNAs 骨关节炎 养血柔肝法 基因测序
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 8-15,42
• 页数: 9页
• 分类号: R274.9
• 字数: 5608字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11724/jdmu.2018.01.02

摘要

目的 分析miRNAs在养血柔肝法“养血软坚胶囊”治疗骨关节炎中的生物学信息.方法 将40只SD大鼠进行前交叉切除(ACLT)造模成骨关节炎模型,模型验证造模成功后,随机分为模型组(n=20)和中药组(n=20).模型组不干预,中药组予大鼠灌胃饲养,药物采用养血柔肝法中成药养血软坚胶囊.4周后取材,提取关节软骨组织的RNA,制备文库,通过数据预处理、测序错误率分布检查、测序数据过滤、差异表达的miRNAs的鉴定、差异表达的miRNA的靶基因的鉴定、差异表达的miRNA的靶基因的功能分析、网络图构建等步骤,对差异表达的miRNAs进行数据分析.并RT-PCR验证所得结果.结果 中药组与模型组并共有35个miRNAs表达有差异.其中7个上调(共调控了1174个靶基因),28个下调(共调控了2216个靶基因);对差异miRNAs的靶基因进行蛋白互作网络分析(PPI)后,通过连接度最高的几个节点,获得了19个重要的靶基因.关节软骨中,中药组rno-miR-199a-5p、mo-miR-140-3p的表达高于模型组,中药组rno-miR-300-3p、mo-miR-9a-3p的表达低于模型组,差异具有统计学意义(P＜0.05).结论 养血柔肝法中药“养血软坚胶囊”可以调控骨关节炎大鼠模型的miR-199a-5p,miR-140-3p,miR-300-3p和miR-9a-3p等miRNAs.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	石印玉	上海中医药大学附属曙光医院骨伤科	171	2229	26.0	38.0
2	庞坚	上海中医药大学附属曙光医院骨伤科	45	226	7.0	15.0
3	高宁阳	上海中医药大学附属曙光医院骨伤科	22	142	5.0	11.0
4	丁立	上海中医药大学附属曙光医院骨伤科	3	1	1.0	1.0
5	熊轶喆	上海中医药大学附属曙光医院骨伤科	3	8	1.0	2.0