肝癌细胞系与正常细胞系中的组蛋白修饰差异分析

• 作者: 刘育仙 李前忠
• 来源期刊: 计算生物学
• 学科: 医学
• 关键词: 肝癌 组蛋白修饰 基因表达
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 页码范围: 49-57
• 页数: 9页
• 分类号: R73

摘要

肝癌是全世界癌症发病率和死亡率都非常高的恶性肿瘤,越来越多的研究发现表观修饰对癌症的发生有重要的影响。为了了解肝癌中组蛋白修饰发生了哪些变化,我们统计了肝癌细胞系HepG2和正常细胞系hepatocyte中的11种组蛋白修饰在启动子区域的组蛋白修饰分布模式,并分析了启动子区域组蛋白修饰和基因表达,以及组蛋白修饰之间的相关性。结果表明这11种组蛋白修饰在启动子区域主要有两种分布模式,癌症细胞系中的组蛋白修饰值普遍比正常细胞系中高;组蛋白修饰与基因表达的Spearman相关性分析表明,H3K9me3在两种细胞系中与基因表达呈相反的相关性,而且发现相关性分布与组蛋白修饰分布趋势一致。通过对两种细胞系高低表达基因上的组蛋白修饰分析,发现高表达基因中组蛋白修饰差异更显著。这些结果表明,分析组蛋白修饰的变化对肝癌的研究具有一定的意义。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李前忠	内蒙古大学草原家畜生殖调控与繁育国家重点实验室	87	366	11.0	15.0
2	刘育仙	内蒙古大学物理科学与技术学院理论生物物理实验室	1	0	0.0	0.0