青藏高原东南部山丹nrDNA ITS和cpDNA petB/petD序列的分子进化特点

• 作者: 唐楠 唐道城 孙静清 巨秀婷 蒋福娟
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 生物学
• 关键词: 青藏高原东南部 山丹 ITS petB/petD 分子进化
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 页码范围: 117-124
• 页数: 8页
• 分类号: Q949.71+8.23
• 字数: 4811字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2018.01.014

摘要

采用改良CTAB法提取青藏高原东南部山丹25个居群所有个体的基因组DNA,选取核基因ITS和叶绿体petB/petD区域进行PCR扩增、纯化和测序.对所有序列对位排列,其中ITS序列总长696 bp,变异位点有4处,共产生7种单倍型,变异位点百分率为0.72％,(G+C)含量60.4％;petB/petD序列总长616 bp,仅1处变异位点和2种单倍型,变异位点百分率为0.16％,(G+C)含量34.6％.表明山丹中,petB/petD区域较ITS序列保守,变异速率较慢.对ITS序列单倍型进行失配分布和中性检验分析发现,山丹现有分布范围可能经历了近期居群小范围扩张,AMOVA分析发现山丹居群的遗传变异主要存在于居群内,NST＞ Gsr(P＞0.01),表明山丹的遗传变异有着不显著的谱系地理结构.因此,山丹ITS序列适合该种的谱系地理学研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙静清		1	1	1.0	1.0